Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms