Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms