Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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