Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERBB3P21860 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms