Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms