Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPI1P17947 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPI1P17947 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPI1P17947 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPI1P17947 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPI1P17947 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPI1P17947 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPI1P17947 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms