Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA6P17658 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms