Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME1P15531 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NME1P15531 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NME1P15531 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms