Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAV1P15498 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAV1P15498 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAV1P15498 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAV1P15498 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms