Protein–RNA interactions for Protein: P13985

HRES1, Putative HTLV-1-related endogenous sequence, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRES1P13985 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRES1P13985 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HRES1P13985 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms