Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODC1P11926 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODC1P11926 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODC1P11926 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ODC1P11926 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODC1P11926 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODC1P11926 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODC1P11926 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ODC1P11926 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODC1P11926 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODC1P11926 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms