Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBP07199 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBP07199 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBP07199 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms