Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13BP05160 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13BP05160 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13BP05160 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13BP05160 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13BP05160 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13BP05160 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13BP05160 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13BP05160 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13BP05160 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13BP05160 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms