Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms