Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms