Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBDO15205 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBDO15205 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBDO15205 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBDO15205 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBDO15205 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBDO15205 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBDO15205 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBDO15205 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms