Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms