Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms