Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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