Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLRF2D3W0D1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms