Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPBD1B2RD01 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms