Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms