Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms