Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms