Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms