Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WSZ3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A0A087WSZ3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms