Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms