Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms