Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms