Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms