Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms