Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW0

TPX2, Targeting protein for Xklp2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPX2Q9ULW0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPX2Q9ULW0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPX2Q9ULW0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms