Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms