Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms