Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP8AP2Q9UKL3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP8AP2Q9UKL3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms