Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms