Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF639Q9UID6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms