Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms