Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms