Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms