Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD5Q9P267 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms