Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms