Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms