Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms