Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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SNX15Q9NRS6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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SNX15Q9NRS6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SNX15Q9NRS6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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SNX15Q9NRS6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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SNX15Q9NRS6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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