Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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