Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms