Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms