Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRN3Q9H3W5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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