Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms